Пакунок: spaln (3.0.2+dfsg-2)

[ Source: spaln  ]

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

Інші пакунки пов'язані з spaln

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: spaln-data

  splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити spaln

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	550.0 kB	1,901.0 kB	[список файлів]
arm64	492.8 kB	2,230.0 kB	[список файлів]
mips64el	529.1 kB	2,342.0 kB	[список файлів]
ppc64el	561.4 kB	2,615.0 kB	[список файлів]
s390x	567.8 kB	2,024.0 kB	[список файлів]