Пакунок: r-bioc-singler (2.6.0+ds-1)

[ Source: r-bioc-singler  ]

BioConductor reference-based single-cell RNA-Seq annotation

Performs unbiased cell type recognition from single-cell RNA sequencing data, by leveraging reference transcriptomic datasets of pure cell types to infer the cell of origin of each single cell independently.

Інші пакунки пов'язані з r-bioc-singler

• dep: libc6 (>= 2.32)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not riscv64]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-beachmat (>= 2.20.0)

  I/O for several formats storing matrix data

• dep: r-bioc-biocneighbors (>= 1.22.0)

  Nearest Neighbor Detection for Bioconductor Packages

• dep: r-bioc-biocparallel (>= 1.38.0)

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• dep: r-bioc-biocsingular (>= 1.20.0)

  Singular Value Decomposition for Bioconductor Packages

• dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.30.1)

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-delayedmatrixstats (>= 1.26.0)

  Functions on Rows and Columns of 'DelayedMatrix' Objects

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0)

  BioConductor assay container

• dep: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• dep: r-cran-rcpp

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• sug: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  generic functions for Bioconductor

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-scater (>= 1.32.0)

  Single-Cell Analysis Toolkit for Gene Expression Data in R

• sug: r-bioc-scran (>= 1.32.0)

  BioConductor methods for single-cell RNA-Seq data analysis

• sug: r-bioc-scrnaseq (>= 2.18.0)

  Пакунок недоступний

• sug: r-bioc-scuttle (>= 1.14.0)

  BioConductor single-cell RNA-Seq analysis utilities

• sug: r-bioc-singlecellexperiment (>= 1.26.0)

  S4 Classes for Single Cell Data

• sug: r-cran-ggplot2

  implementation of the Grammar of Graphics

• sug: r-cran-gridextra

  GNU R package with extensions for the grid package

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-pheatmap

  GNU R package to create pretty heatmaps

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

• sug: r-cran-viridis

  GNU R package for color maps from matplotlib

Завантажити r-bioc-singler

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	335.3 kB	799.0 kB	[список файлів]
arm64	318.9 kB	775.0 kB	[список файлів]
mips64el	320.5 kB	864.0 kB	[список файлів]
ppc64el	338.0 kB	903.0 kB	[список файлів]
riscv64	331.7 kB	702.0 kB	[список файлів]
s390x	342.0 kB	843.0 kB	[список файлів]