Пакунок: hts-nim-tools (0.2.1-1)

[ Source: hts-nim-tools  ]

tools biological sequences: bam-filter, count-reads, vcf-check

This package provides several tools that (at least at the time of their creation) provide functionalities beyond the routine provided by samtools and other reverse dependencies of the htslib.

These new tools are

 • bam-filter : filter BAM/CRAM/SAM files with a simple expression language
 • count-reads: count BAM/CRAM reads in regions given in a BED file
 • vcf-check  : check regions of a VCF against a background for missing chunks

and yes, as the name suggests, these tools are all implemented in nim, using the nim-hts (upstream: hts-nim) wrapper for the htslib.

Інші пакунки пов'язані з hts-nim-tools

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: nim-hts-dev

  wrapper for hts C library

Завантажити hts-nim-tools

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	198.0 kB	864.0 kB	[список файлів]
arm64	164.6 kB	844.0 kB	[список файлів]
armel	182.9 kB	832.0 kB	[список файлів]
armhf	182.9 kB	604.0 kB	[список файлів]
i386	186.0 kB	843.0 kB	[список файлів]
mips64el	137.8 kB	951.0 kB	[список файлів]
ppc64el	158.6 kB	916.0 kB	[список файлів]