Пакунок: unifrac-tools (1.4-3 and others)

[ Source: unifrac-tools  ]

high-performance phylogenetic diversity calculations (binaries)

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains target binaries ssu and faithpd

Інші пакунки пов'язані з unifrac-tools

• dep: libblas3

  Реалізації основних підпрограм лінійної алгебри (колективна бібліотека)

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [alpha, amd64, x32]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblapacke (>= 3.12.0)

  Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version

• dep: liblz4-1 (>= 0.0~r130)

  Бібліотека швидкого алгоритму стиснення LZ — виконавчі файли

• dep: libssu0

  high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: libsz2 (>= 1.1.3)

  Adaptive Entropy Coding library - SZIP

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити unifrac-tools

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	1.4-3+b1	1,220.5 kB	8,839.0 kB	[список файлів]
amd64	1.4-3+b2	1,630.4 kB	7,938.0 kB	[список файлів]
arm64	1.4-3+b2	1,407.7 kB	8,574.0 kB	[список файлів]
armel	1.4-3+b2	1,488.8 kB	9,361.0 kB	[список файлів]
armhf	1.4-3+b2	1,433.5 kB	6,258.0 kB	[список файлів]
i386	1.4-3+b2	1,488.4 kB	9,868.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	1.4-3+b1	1,507.2 kB	15,977.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	1.4-3+b1	1,006.4 kB	7,382.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.4-3+b2	1,175.9 kB	8,790.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.4-3+b2	1,398.9 kB	10,110.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.4-3+b2	1,743.7 kB	7,082.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	1.4-3+b1	1,263.2 kB	6,516.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	1.4-3+b1	1,538.9 kB	7,514.0 kB	[список файлів]