Пакунок: sumatra (1.0.36+ds-2 and others)

Links for sumatra

Debian Resources:

Download Source Package sumatra:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Tim Booth (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Pierre Gruet (QA Page)

External Resources:

Homepage [metabarcoding.org]

Similar packages:

fast and exact comparison and clustering of sequences

With the development of next-generation sequencing, efficient tools are needed to handle millions of sequences in reasonable amounts of time. Sumatra is a program developed by the LECA. Sumatra aims to compare sequences in a way that is fast and exact at the same time. This tool has been developed to be adapted to the type of data generated by DNA metabarcoding, i.e. entirely sequenced, short markers. Sumatra computes the pairwise alignment scores from one dataset or between two datasets, with the possibility to specify a similarity threshold under which pairs of sequences that have a lower similarity are not reported. The output can then go through a classification process with programs such as MCL or MOTHUR.

Інші пакунки пов'язані з sumatra

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.33) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.7) [not alpha, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libsuma1 (>= 1.0.35)

shared library for sumatra and sumaclust
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити sumatra

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	1.0.36+ds-2	78.7 kB	176.0 kB	[список файлів]
amd64	1.0.36+ds-2	78.5 kB	136.0 kB	[список файлів]
arm64	1.0.36+ds-2	77.8 kB	175.0 kB	[список файлів]
armel	1.0.36+ds-2	78.9 kB	175.0 kB	[список файлів]
armhf	1.0.36+ds-2	78.0 kB	175.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	1.0.36+ds-2	79.7 kB	132.0 kB	[список файлів]
i386	1.0.36+ds-2	78.6 kB	135.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	1.0.36+ds-2	81.2 kB	143.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	1.0.36+ds-2	77.6 kB	135.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.0.36+ds-2	78.1 kB	176.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	1.0.36+ds-2	79.1 kB	240.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.0.36+ds-2	79.0 kB	176.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.0.36+ds-2+b1	78.1 kB	129.0 kB	[список файлів]
s390x	1.0.36+ds-2	78.1 kB	131.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	1.0.36+ds-2	79.0 kB	175.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	1.0.36+ds-2	77.7 kB	1,136.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	1.0.36+ds-2	78.6 kB	135.0 kB	[список файлів]