Пакунок: provean (1.1.5+ds-2 and others)

[ Source: provean  ]

Protein Variation Effect Analyzer

PROVEAN (Protein Variation Effect Analyzer) is a software tool which predicts whether an amino acid substitution or indel has an impact on the biological function of a protein.

PROVEAN is useful for filtering sequence variants to identify nonsynonymous or indel variants that are predicted to be functionally important.

The performance of PROVEAN is comparable to popular tools such as SIFT or PolyPhen-2.

A fast computation approach to obtain pairwise sequence alignment scores enabled the generation of precomputed PROVEAN predictions for 20 single AA substitutions and a single AA deletion at every amino acid position of all protein sequences in human and mouse.

Інші пакунки пов'язані з provean

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.33) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, hppa, i386]

• dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [not riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Завантажити provean

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	1.1.5+ds-2	51.0 kB	161.0 kB	[список файлів]
amd64	1.1.5+ds-2	48.1 kB	141.0 kB	[список файлів]
arm64	1.1.5+ds-2	44.7 kB	125.0 kB	[список файлів]
armel	1.1.5+ds-2	45.4 kB	132.0 kB	[список файлів]
armhf	1.1.5+ds-2	47.1 kB	108.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	1.1.5+ds-2	50.9 kB	137.0 kB	[список файлів]
i386	1.1.5+ds-2	51.0 kB	144.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	1.1.5+ds-2	61.8 kB	228.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	1.1.5+ds-2	41.5 kB	128.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.1.5+ds-2	49.9 kB	166.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	1.1.5+ds-2	48.5 kB	219.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.1.5+ds-2	48.8 kB	153.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.1.5+ds-2+b1	50.9 kB	122.0 kB	[список файлів]
s390x	1.1.5+ds-2	44.1 kB	137.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	1.1.5+ds-2	50.0 kB	120.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	1.1.5+ds-2	41.5 kB	131.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	1.1.5+ds-2	46.4 kB	128.0 kB	[список файлів]