Пакунок: meryl (0~20150903+r2013-8 and others)

[ Source: kmer  ]

in- and out-of-core kmer counting and utilities

meryl computes the kmer content of genomic sequences. Kmer content is represented as a list of kmers and the number of times each occurs in the input sequences. The kmer can be restricted to only the forward kmer, only the reverse kmer, or the canonical kmer (lexicographically smaller of the forward and reverse kmer at each location). Meryl can report the histogram of counts, the list of kmers and their counts, or can perform mathematical and set operations on the processed data files.

This package is part of the Kmer suite.

Інші пакунки пов'язані з meryl

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• sug: gridengine-client

  Utilities for Grid Engine queue management

Завантажити meryl

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	0~20150903+r2013-8+b3	219.2 kB	1,770.0 kB	[список файлів]
amd64	0~20150903+r2013-8+b3	192.7 kB	1,438.0 kB	[список файлів]
arm64	0~20150903+r2013-8+b3	185.5 kB	1,571.0 kB	[список файлів]
armel	0~20150903+r2013-8+b3	195.5 kB	1,635.0 kB	[список файлів]
armhf	0~20150903+r2013-8+b3	198.5 kB	1,379.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	0~20150903+r2013-8+b3	282.7 kB	2,036.0 kB	[список файлів]
i386	0~20150903+r2013-8+b3	242.0 kB	1,919.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	0~20150903+r2013-8+b3	268.4 kB	2,565.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	0~20150903+r2013-8+b3	243.5 kB	1,955.0 kB	[список файлів]
mips64el	0~20150903+r2013-8+b3	210.1 kB	1,821.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	0~20150903+r2013-8+b3	200.8 kB	1,834.0 kB	[список файлів]
ppc64el	0~20150903+r2013-8+b3	208.3 kB	1,829.0 kB	[список файлів]
riscv64 (unofficial port)	0~20150903+r2013-8+b3	207.9 kB	1,258.0 kB	[список файлів]
s390x	0~20150903+r2013-8+b3	175.0 kB	1,479.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	0~20150903+r2013-8+b3	278.3 kB	1,891.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	0~20150903+r2013-8+b3	178.9 kB	7,480.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	0~20150903+r2013-8+b3	197.3 kB	1,435.0 kB	[список файлів]