Пакунок: macs (3.0.1-2 and others)

Links for macs

Debian Resources:

Download Source Package macs:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.

Інші пакунки пов'язані з macs

depends

recommends

suggests

enhances

dep: cython3 [x32]

C-Extensions for Python 3
dep: cython3-legacy [alpha, hppa, ppc64, sparc64]

C-Extensions for Python 3 (legacy version 0.29)
dep: libc6 (>= 2.29) [hppa, ppc64, sparc64, x32]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, hppa, ia64, ppc64, sh4, sparc64, x32]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.12) [x32]

dep: python3 (<< 3.13) [not ia64, x32]

dep: python3 (<< 3.9) [ia64]

dep: python3 (>= 3.11~) [not ia64]

dep: python3 (>= 3.8~) [ia64]
dep: python3-cykhash [not alpha, hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]

cython wrapper for khash-sets/maps, efficient implementation of isin and unique
dep: python3-hmmlearn [not alpha, hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]

unsupervised learning and inference of Hidden Markov Models
dep: python3-numpy [alpha, hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]

Fast array facility to the Python language (Python 3)

dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [not alpha, hppa, ia64, ppc64, sh4, sparc64, x32]

dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [sh4]
dep: python3-numpy-abi9 [not alpha, hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]

virtual package provided by python3-numpy
dep: python3-scipy [not alpha, hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]

scientific tools for Python 3
dep: python3-sklearn [not alpha, hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]

Python modules for machine learning and data mining - Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64el, riscv64, s390x]

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [m68k, sh4]

Завантажити macs

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	2.2.9.1-1+b1	3,178.8 kB	11,058.0 kB	[список файлів]
amd64	3.0.1-2	4,425.1 kB	14,386.0 kB	[список файлів]
arm64	3.0.1-2	3,924.4 kB	14,472.0 kB	[список файлів]
armel	3.0.1-2	3,938.0 kB	13,353.0 kB	[список файлів]
armhf	3.0.1-2	4,036.1 kB	10,033.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	2.2.9.1-1+b1	3,147.9 kB	10,806.0 kB	[список файлів]
i386	3.0.1-2	4,419.1 kB	15,630.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	2.2.6-3+b1	2,653.4 kB	11,172.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	3.0.1-2	3,943.7 kB	13,081.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	2.2.9.1-1+b1	3,177.0 kB	11,663.0 kB	[список файлів]
ppc64el	3.0.1-2	4,251.0 kB	17,997.0 kB	[список файлів]
riscv64	3.0.1-2	4,506.9 kB	11,445.0 kB	[список файлів]
s390x	3.0.1-2	4,265.3 kB	14,839.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	3.0.1-2	4,869.1 kB	13,307.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	2.2.9.1-1+b1	2,977.6 kB	28,654.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	2.2.9.1-1	2,527.6 kB	5,365.0 kB	[список файлів]