[ Source: blasr ]
Пакунок: blasr (5.3.5+dfsg-6 and others)
Links for blasr
Debian Resources:
Download Source Package blasr:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
mapping single-molecule sequencing reads
Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.
Інші пакунки пов'язані з blasr
|
|
|
|
-
- dep: libblasr [x32]
- tools for aligning PacBio reads to target sequences
-
- dep: libblasr5.3.5 (>= 5.3.5+dfsg) [not hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
- tools for aligning PacBio reads to target sequences
-
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [hppa, ppc64]
- dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]
- Допоміжна бібліотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [x32]
- Пакунок недоступний
- dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sh4]
-
- dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Пакунок недоступний
-
- dep: libhdf5-10 [hppa, ppc64]
- Пакунок недоступний
-
- dep: libhdf5-100 [x32]
- Пакунок недоступний
-
- dep: libhdf5-cpp-100 (>= 1.10.0) [x32]
- Пакунок недоступний
-
- dep: libhdf5-cpp-103 (>= 1.10.1) [m68k, sh4]
- HDF5 - C++ runtime files - serial version (transitional package)
-
- dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5) [not hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
- HDF5 - C++ runtime files - serial version
-
- dep: libhdf5-cpp-11 (>= 1.8.15-patch1) [ppc64]
- Пакунок недоступний
- dep: libhdf5-cpp-11 (>= 1.8.16) [hppa]
-
- dep: libpbbam0.23.0 (>= 0.23.0+dfsg) [m68k, sh4]
- Пакунок недоступний
-
- dep: libpbbam2.4.0 (>= 2.4.0+dfsg) [not hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
- Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
-
- dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg) [not hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
- data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
-
- dep: libpbdata [x32]
- tools for handling PacBio sequences
-
- dep: libpbihdf [x32]
- tools for handling PacBio hdf5 files
-
- dep: libpbseq [m68k, sh4]
- library for analyzing PacBio sequencing data
- dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-4~) [not hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [hppa, ppc64, x32]
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
Завантажити blasr
| Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 5.3.5+dfsg-6+b4 | 211.9 kB | 744.0 kB | [список файлів] |
| amd64 | 5.3.5+dfsg-6+b3 | 219.0 kB | 664.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 5.3.5+dfsg-6+b3 | 190.0 kB | 616.0 kB | [список файлів] |
| hppa (unofficial port) | 0~20150724+git3ca7fe8-1+b2 | 1,423.6 kB | 6,078.0 kB | [список файлів] |
| ia64 (unofficial port) | 5.3.5+dfsg-6+b4 | 271.0 kB | 1,226.0 kB | [список файлів] |
| m68k (unofficial port) | 5.3.3+dfsg-1+b1 | 180.6 kB | 591.0 kB | [список файлів] |
| mips64el | 5.3.5+dfsg-6+b3 | 197.4 kB | 760.0 kB | [список файлів] |
| ppc64 (unofficial port) | 0~20150724+git3ca7fe8-1+b2 | 1,367.5 kB | 6,824.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 5.3.5+dfsg-6+b3 | 215.2 kB | 744.0 kB | [список файлів] |
| riscv64 | 5.3.5+dfsg-6+b1 | 216.3 kB | 528.0 kB | [список файлів] |
| sh4 (unofficial port) | 5.3.3+dfsg-1+b1 | 223.0 kB | 543.0 kB | [список файлів] |
| x32 (unofficial port) | 5.3-1+b1 | 459.5 kB | 1,607.0 kB | [список файлів] |