Пакунок: python3-pairix (0.3.7-7 and others)

Links for python3-pairix

Debian Resources:

Download Source Package python-pairix:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

1D/2D indexing and querying with a pair of genomic coordinates

Pairix is a tool for indexing and querying on a block-compressed text file containing pairs of genomic coordinates.

Pairix is a stand-alone C program that was written on top of tabix as a tool for the 4DN-standard pairs file format describing Hi-C data: pairs_format_specification.md

However, Pairix can be used as a generic tool for indexing and querying any bgzipped text file containing genomic coordinates, for either 2D- or 1D- indexing and querying.

For example: given the custom text file below, you want to extract specific lines from the Pairs file further below. An awk command would read the Pairs file from beginning to end. Pairix creates an index and uses it to access the file from a relevant position by taking advantage of bgzf compression, allowing for a fast query on large files.

Інші пакунки пов'язані з python3-pairix

depends

recommends

suggests

enhances

dep: python3 (<< 3.10) [hppa]

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.13) [not hppa]

dep: python3 (>= 3.11~) [not hppa]

dep: python3 (>= 3.9~) [hppa]

Завантажити python3-pairix

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	0.3.7-7	44.1 kB	290.0 kB	[список файлів]
amd64	0.3.7-7	44.9 kB	218.0 kB	[список файлів]
arm64	0.3.7-7	41.4 kB	288.0 kB	[список файлів]
armel	0.3.7-7	39.1 kB	190.0 kB	[список файлів]
armhf	0.3.7-7	37.5 kB	150.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	0.3.7-4	40.6 kB	120.0 kB	[список файлів]
i386	0.3.7-7	49.5 kB	226.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	0.3.7-7	54.3 kB	353.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	0.3.7-7	39.2 kB	190.0 kB	[список файлів]
mips64el	0.3.7-7	39.4 kB	302.0 kB	[список файлів]
ppc64el	0.3.7-7	51.8 kB	288.0 kB	[список файлів]
riscv64	0.3.7-7	45.6 kB	184.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	0.3.7-7	47.7 kB	286.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	0.3.7-7	45.1 kB	206.0 kB	[список файлів]