Пакунок: liballelecount-perl (4.3.0-2)

[ Source: allelecount  ]

Perl interface to NGS copy number algorithms

Support code for NGS copy number algorithms. Takes a file of locations and a [cr|b]am file and generates a count of coverage of each allele [ACGT] at that location (given any filter settings).

The alleleCount package primarily exists to prevent code duplication between some other projects, specifically AscatNGS and Battenberg.

This package provided the Perl interface to alleleCounter providing Sanger::CGP::AlleleCount::Genotype.

Інші пакунки пов'язані з liballelecount-perl

• dep: libconst-fast-perl

  facility for creating read-only scalars, arrays, and hashes

• dep: libdevel-cover-perl

  Perl tool for determining code coverage metrics

• dep: libfile-slurp-perl

  single call read & write file routines

• dep: libfile-which-perl

  Perl module for searching paths for executable programs

• dep: libipc-system-simple-perl

  Perl module to run commands simply, with detailed diagnostics

• dep: libjson-perl

  Модуль для обробки відформатованих JSON-даних

• dep: libpod-coverage-perl

  checker for comprehensiveness of perl module documentation

• dep: libtest-fatal-perl

  module for testing code with exceptions

• dep: libtry-tiny-perl

  module providing minimalistic try/catch

• dep: perl

  Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)

Завантажити liballelecount-perl

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
all	24.4 kB	81.0 kB	[список файлів]