Пакунок: ggd-utils (1.0.0+ds-1 and others)

[ Source: ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Інші пакунки пов'язані з ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, loong64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ppc64, x32]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

• dep: libgo22 [alpha, ppc64, sparc64, x32]

  Runtime library for GNU Go applications

Завантажити ggd-utils

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	1.0.0+ds-1+b9	190.5 kB	759.0 kB	[список файлів]
amd64	1.0.0+ds-1+b17	2,207.2 kB	6,605.0 kB	[список файлів]
arm64	1.0.0+ds-1+b17	1,894.2 kB	6,162.0 kB	[список файлів]
armel	1.0.0+ds-1+b17	1,965.2 kB	6,504.0 kB	[список файлів]
armhf	1.0.0+ds-1+b17	1,958.3 kB	6,504.0 kB	[список файлів]
i386	1.0.0+ds-1+b17	2,126.7 kB	6,428.0 kB	[список файлів]
loong64 (unofficial port)	1.0.0+ds-1+b5	1,790.6 kB	6,011.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.0.0+ds-1+b17	1,791.6 kB	7,204.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	1.0.0+ds-1+b9	219.6 kB	1,088.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.0.0+ds-1+b17	1,889.4 kB	6,417.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.0.0+ds-1+b12	1,963.4 kB	6,225.0 kB	[список файлів]
s390x	1.0.0+ds-1+b17	2,006.4 kB	6,865.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	1.0.0+ds-1+b8	187.8 kB	1,274.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	1.0.0+ds-1+b9	199.3 kB	716.0 kB	[список файлів]