Пакунок: density-fitness (1.0.8-4 and others)

[ Source: density-fitness  ]

Calculates per-residue electron density scores

The program density-fitness calculates electron density metrics, for main- (includes Cβ atom) and side-chain atoms of individual residues.

For this calculation, the program uses the structure model in either PDB or mmCIF format and the electron density from the 2mFo-DFc and mFo-DFc maps. If these maps are not readily available, the MTZ file and model can be used to calculate maps clipper. Density-fitness support both X-ray and electron diffraction data.

This program is essentially a reimplementation of edstats, a program available from the CCP4 suite. However, the output now contains only the RSR, SRSR and RSCC fields as in edstats with the addition of EDIAm and OPIA and no longer requires pre-calculated map coefficients.

Інші пакунки пов'язані з density-fitness

• dep: libboost-date-time1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  set of date-time libraries based on generic programming concepts

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  Бібліотека Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [hppa]

  Бібліотека параметрів програми на Сі++

• dep: libboost-regex1.83.0-icu72 [sparc64]

  virtual package provided by libboost-regex1.83.0

• dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, hppa, ia64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

• dep: libccp4c0 (>= 8.0.0) [sparc64]

  CCP4 core functionality - C runtime

• dep: libcifpp1 (>= 1.0.1) [hppa]

  Пакунок недоступний

• dep: libcifpp5 (>= 5.0.7.1) [not hppa]

  Library files for libcifpp

• dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

  object oriented library for crystallographic computing

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libnewuoa0 (>= 0.1.2) [sparc64]

  Library file for libnewuoa

• dep: libpdb-redo1 (>= 1.0.2-3~) [hppa]

  Пакунок недоступний

• dep: libpdb-redo3 (>= 3.0.5) [not hppa]

  Library file for libpdb-redo

• dep: libstdc++6 (>= 11) [not riscv64, sh4, sparc64]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64, sh4, sparc64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: libzeep5.1 (>= 5.1.4) [hppa]

  Library file for libzeep

  dep: libzeep5.1 (>= 5.1.8) [not hppa]

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.2) [not hppa]

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити density-fitness

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	1.0.8-4	447.6 kB	5,608.0 kB	[список файлів]
amd64	1.0.8-4	448.0 kB	5,548.0 kB	[список файлів]
arm64	1.0.8-4	443.8 kB	5,544.0 kB	[список файлів]
armel	1.0.8-4	442.7 kB	5,531.0 kB	[список файлів]
armhf	1.0.8-4	443.1 kB	5,503.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	1.0.0-4	104.9 kB	359.0 kB	[список файлів]
i386	1.0.8-4	452.0 kB	5,554.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	1.0.8-4	461.7 kB	5,675.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	1.0.8-4	444.3 kB	5,542.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.0.8-4	447.9 kB	5,615.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	1.0.8-4	449.3 kB	5,610.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.0.8-4	449.9 kB	5,608.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.0.8-4+b1	450.5 kB	5,537.0 kB	[список файлів]
s390x	1.0.8-4	444.2 kB	5,556.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	1.0.8-4	450.2 kB	5,542.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	1.0.8-4+b1	443.8 kB	6,445.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	1.0.8-4	446.8 kB	5,535.0 kB	[список файлів]