all options
stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  sid  ]
[ Source: bedtools  ]

Пакунок: bedtools (2.30.0+dfsg-2 and others)

Links for bedtools


Debian Resources:

Download Source Package bedtools:


External Resources:

Similar packages:

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: use::analysing, use::comparing, Data Conversion, use::filtering, works-with::biological-sequence

Інші пакунки пов'язані з bedtools

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Завантажити bedtools

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Версія Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
alpha (unofficial port) 2.30.0+dfsg-2 654.2 kB2,548.0 kB [список файлів]
amd64 2.30.0+dfsg-2 647.7 kB2,060.0 kB [список файлів]
arm64 2.30.0+dfsg-2 565.5 kB1,872.0 kB [список файлів]
armel 2.30.0+dfsg-2 535.5 kB1,759.0 kB [список файлів]
armhf 2.30.0+dfsg-2 558.9 kB1,275.0 kB [список файлів]
hppa (unofficial port) 2.30.0+dfsg-2 638.3 kB2,031.0 kB [список файлів]
i386 2.30.0+dfsg-2 707.9 kB2,279.0 kB [список файлів]
ia64 (unofficial port) 2.30.0+dfsg-2 816.5 kB4,408.0 kB [список файлів]
m68k (unofficial port) 2.30.0+dfsg-2 622.1 kB2,047.0 kB [список файлів]
mips64el 2.30.0+dfsg-2 584.8 kB2,591.0 kB [список файлів]
mipsel 2.30.0+dfsg-2 603.8 kB2,463.0 kB [список файлів]
ppc64 (unofficial port) 2.30.0+dfsg-2 659.2 kB2,776.0 kB [список файлів]
ppc64el 2.30.0+dfsg-2 664.3 kB2,520.0 kB [список файлів]
riscv64 (unofficial port) 2.30.0+dfsg-2 603.9 kB1,530.0 kB [список файлів]
s390x 2.30.0+dfsg-2 566.3 kB2,100.0 kB [список файлів]
sh4 (unofficial port) 2.30.0+dfsg-2 748.8 kB1,876.0 kB [список файлів]
sparc64 (unofficial port) 2.26.0+dfsg-5 460.9 kB1,898.0 kB [список файлів]
x32 (unofficial port) 2.30.0+dfsg-2 642.1 kB1,927.0 kB [список файлів]