Пакунок: sigma-align (1.1.3-6)

[ Source: sigma-align  ]

Simple greedy multiple alignment of non-coding DNA sequences

Sigma (“Simple greedy multiple alignment”) is an alignment program. It's algorithm and scoring scheme are designed specifically for non-coding DNA sequence.

It uses a strategy of seeking the best possible gapless local alignments. This happens at each step making the best possible alignment consistent with existing alignments. It scores the significance of the alignment based on the lengths of the aligned fragments and a background model. These may be supplied or estimated from an auxiliary file of intergenic DNA.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Інші пакунки пов'язані з sigma-align

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libglib2.0-0 (>= 2.12.0)

  Glib бібліотека алгоритмів на Сі

Завантажити sigma-align

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	23.6 kB	62.0 kB	[список файлів]
arm64	22.8 kB	58.0 kB	[список файлів]
armhf	20.7 kB	45.0 kB	[список файлів]
i386	24.2 kB	61.0 kB	[список файлів]