[ Source: gmap ]
Пакунок: gmap (2019-01-24-1) [non-free]
Links for gmap
Debian Resources:
Download Source Package gmap:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Shaun Jackman (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Alexandre Mestiashvili (QA Page)
External Resources:
- Homepage [research-pub.gene.com]
Similar packages:
spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads
This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of
* known splice sites and identify novel splice sites. * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).GSNAP can align bisulfite-treated DNA.
Інші пакунки пов'язані з gmap
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль
-
- dep: libc6 (>= 2.14)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: perl
- Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
Завантажити gmap
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| amd64 | 5,833.6 kB | 52,092.0 kB | [список файлів] |