all options
stretch  ] [  stretch-backports  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  sid  ]
[ Source: samtools  ]

Пакунок: samtools (1.9-4)

Links for samtools


Debian Resources:

Download Source Package samtools:


External Resources:

Similar packages:

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Networking: Client, Network Protocol: FTP, protocol::http, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: Ncurses TUI, Purpose: use::analysing, use::calculating, Filtering, Works with: Biological Sequence

Інші пакунки пов'язані з samtools

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Завантажити samtools

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
amd64 432.3 kB1,008.0 kB [список файлів]
arm64 413.7 kB952.0 kB [список файлів]
armel 395.4 kB917.0 kB [список файлів]
armhf 400.4 kB785.0 kB [список файлів]
mips 414.5 kB1,018.0 kB [список файлів]
mips64el 422.8 kB1,077.0 kB [список файлів]
mipsel 417.7 kB1,018.0 kB [список файлів]
ppc64el 455.5 kB1,480.0 kB [список файлів]
s390x 407.8 kB1,020.0 kB [список файлів]