Пакунок: yaha (0.1.83-2)

[ Source: yaha  ]

find split-read mappings on single-end queries

yaha is an open source, flexible, sensitive and accurate DNA aligner designed for single-end reads. It supports three major modes of operation:

 * The default “Optimal Query Coverage” (-OQC) mode reports the
   best set of alignments that cover the length of each query.
 * Using “Filter By Similarity” (-FBS), along with the best set of
   alignments, yaha will also output alignments that are highly similar
   to an alignment in the best set.
 * Finally, yaha can output all the alignments found for each query.

The -OQC and -FBS modes are specifically tuned to form split read mappings that can be used to accurately identify structural variation events (deletions, duplications, insertions or inversions) between the subject query and the reference genome.

Інші пакунки пов'язані з yaha

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [not arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

Завантажити yaha

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	42.6 kB	109.0 kB	[список файлів]
arm64	39.4 kB	101.0 kB	[список файлів]
armel	35.8 kB	92.0 kB	[список файлів]
armhf	35.8 kB	72.0 kB	[список файлів]
i386	45.9 kB	116.0 kB	[список файлів]
mips64el	46.1 kB	129.0 kB	[список файлів]
mipsel	45.0 kB	123.0 kB	[список файлів]
ppc64el	48.4 kB	145.0 kB	[список файлів]
s390x	41.2 kB	113.0 kB	[список файлів]