Пакунок: tantan (23-1)

[ Source: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, works-with::biological-sequence

Інші пакунки пов'язані з tantan

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

Завантажити tantan

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	37.9 kB	106.0 kB	[список файлів]
arm64	34.8 kB	94.0 kB	[список файлів]
armel	34.0 kB	93.0 kB	[список файлів]
armhf	32.8 kB	73.0 kB	[список файлів]
i386	39.7 kB	105.0 kB	[список файлів]
mips64el	40.2 kB	123.0 kB	[список файлів]
mipsel	40.4 kB	117.0 kB	[список файлів]
ppc64el	39.8 kB	146.0 kB	[список файлів]
s390x	35.8 kB	106.0 kB	[список файлів]