Пакунок: murasaki (1.68.6-12)

[ Source: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Інші пакунки пов'язані з murasaki

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  Операції з файловою системою (переносимі шляхи, операції з теками тощо) на Сі++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Бібліотека Boost.Iostreams

• dep: libboost-regex1.74.0-icu67

  virtual package provided by libboost-regex1.74.0

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Завантажити murasaki

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	509.4 kB	3,247.0 kB	[список файлів]
arm64	445.1 kB	2,871.0 kB	[список файлів]
armel	369.5 kB	2,377.0 kB	[список файлів]
armhf	378.9 kB	1,689.0 kB	[список файлів]
i386	526.6 kB	3,105.0 kB	[список файлів]
mips64el	481.2 kB	3,955.0 kB	[список файлів]
mipsel	474.4 kB	3,599.0 kB	[список файлів]
ppc64el	504.5 kB	4,235.0 kB	[список файлів]
s390x	451.1 kB	3,355.0 kB	[список файлів]