Пакунок: lighter (1.1.2-5)

[ Source: lighter  ]

fast and memory-efficient sequencing error corrector

Lighter is a fast, memory-efficient tool for correcting sequencing errors. Lighter avoids counting k-mers. Instead, it uses a pair of Bloom filters, one holding a sample of the input k-mers and the other holding k-mers likely to be correct. As long as the sampling fraction is adjusted in inverse proportion to the depth of sequencing, Bloom filter size can be held constant while maintaining near-constant accuracy. Lighter is parallelized, uses no secondary storage, and is both faster and more memory-efficient than competing approaches while achieving comparable accuracy.

Інші пакунки пов'язані з lighter

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити lighter

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	45.6 kB	124.0 kB	[список файлів]
arm64	43.9 kB	116.0 kB	[список файлів]
armel	43.7 kB	119.0 kB	[список файлів]
armhf	43.8 kB	103.0 kB	[список файлів]
i386	50.5 kB	131.0 kB	[список файлів]
mips64el	48.6 kB	131.0 kB	[список файлів]
mipsel	52.4 kB	137.0 kB	[список файлів]
ppc64el	48.9 kB	180.0 kB	[список файлів]
s390x	45.4 kB	128.0 kB	[список файлів]