tüm seçenekler
stretch  ] [  stretch-backports  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Kaynak: rna-star  ]

Paket: rna-star (2.7.8a+dfsg-2 ve diğerleri)

rna-star için bağlantılar

Screenshot

Debian Kaynakları:

rna-star Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Benzer paketler:

ultrafast universal RNA-seq aligner

Spliced Transcripts Alignment to a Reference (STAR) software based on a previously undescribed RNA-seq alignment algorithm that uses sequential maximum mappable seed search in uncompressed suffix arrays followed by seed clustering and stitching procedure. STAR outperforms other aligners by a factor of >50 in mapping speed, aligning to the human genome 550 million 2 × 76 bp paired-end reads per hour on a modest 12-core server, while at the same time improving alignment sensitivity and precision. In addition to unbiased de novo detection of canonical junctions, STAR can discover non-canonical splices and chimeric (fusion) transcripts, and is also capable of mapping full-length RNA sequences. Using Roche 454 sequencing of reverse transcription polymerase chain reaction amplicons, the authors experimentally validated 1960 novel intergenic splice junctions with an 80-90% success rate, corroborating the high precision of the STAR mapping strategy.

Etiketler: Biyoloji: Nükleik Asitler, Alan: Biyoloji, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Rol: Program, Amaç: use::analysing, works-with::biological-sequence

rna-star ile İlgili Diğer Paketler

  • bağımlılıklar
  • tavsiye edilen
  • önerilen
  • enhances

rna-star indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari Sürüm Paket Boyutu Kurulu Boyut Dosyalar
amd64 2.7.8a+dfsg-2 1.248,6 kB21.606,0 kB [dosya listesi]
arm64 2.7.8a+dfsg-2 630,5 kB2.300,0 kB [dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port) 2.4.2a+dfsg-1+b1 314,5 kB691,0 kB [dosya listesi]
mips64el 2.7.8a+dfsg-2 617,4 kB2.780,0 kB [dosya listesi]
ppc64el 2.7.8a+dfsg-2 670,2 kB2.812,0 kB [dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port) 2.4.2a+dfsg-1 405,5 kB734,0 kB [dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port) 2.5.2a+dfsg-2 361,0 kB797,0 kB [dosya listesi]