Paket: maq (0.7.1-9 ve diğerleri)

[ Kaynak: maq  ]

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

Etiketler: Alan: Biyoloji, Biyoinformatik, Geliştirildiği dil: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Kullanıcı Arayüzü: Komut Satırı, Rol: role::program, scope::utility, Amaç: Ek etiket gerektiriyor, Analiz, use::comparing, use::searching, Desteklenen Biçimler: Ek etiket gerektiriyor, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

maq ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.29) [alpha, ia64, riscv64, sh4 değil]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [sparc64]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  compression library - runtime

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

maq indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	0.7.1-9	304,7 kB	584,0 kB	[dosya listesi]
amd64	0.7.1-9	295,7 kB	543,0 kB	[dosya listesi]
arm64	0.7.1-9	286,7 kB	519,0 kB	[dosya listesi]
armel	0.7.1-9	285,5 kB	530,0 kB	[dosya listesi]
armhf	0.7.1-9	286,9 kB	474,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	0.7.1-9	309,5 kB	559,0 kB	[dosya listesi]
i386	0.7.1-9	306,2 kB	575,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	0.7.1-9	329,5 kB	752,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	0.7.1-9	297,1 kB	558,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	0.7.1-9	296,9 kB	578,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	0.7.1-9	301,7 kB	647,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	0.7.1-9	304,8 kB	647,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	0.7.1-9+b1	298,6 kB	498,0 kB	[dosya listesi]
s390x	0.7.1-9	288,4 kB	547,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	0.7.1-9	318,8 kB	527,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	0.7.1-9	289,3 kB	546,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	0.7.1-9	295,1 kB	539,0 kB	[dosya listesi]