tüm seçenekler
jessie  ] [  stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Kaynak: idba  ]

Paket: idba (1.1.3-3)

idba için bağlantılar

Screenshot

Debian Kaynakları:

idba Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Benzer paketler:

iterative De Bruijn Graph short read assemblers

IDBA stands for iterative de Bruijn graph assembler. In computational sequence biology, an assembler solves the puzzle coming from large sequencing machines that feature many gigabytes of short reads from a large genome.

This package provides several flavours of the IDBA assembler, as they all share the same source tree but serve different purposes and evolved over time.

IDBA is the basic iterative de Bruijn graph assembler for second-generation sequencing reads. IDBA-UD, an extension of IDBA, is designed to utilize paired-end reads to assemble low-depth regions and use progressive depth on contigs to reduce errors in high-depth regions. It is a generic purpose assembler and especially good for single-cell and metagenomic sequencing data. IDBA-Hybrid is another update version of IDBA-UD, which can make use of a similar reference genome to improve assembly result. IDBA-Tran is an iterative de Bruijn graph assembler for RNA-Seq data.

idba ile İlgili Diğer Paketler

  • bağımlılıklar
  • tavsiye edilen
  • önerilen
  • enhances

idba indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari Paket Boyutu Kurulu Boyut Dosyalar
alpha (resmi olmayan port) 385,1 kB2.951,0 kB [dosya listesi]
amd64 371,8 kB2.571,0 kB [dosya listesi]
arm64 333,1 kB2.191,0 kB [dosya listesi]
armel 319,3 kB2.199,0 kB [dosya listesi]
armhf 329,5 kB1.575,0 kB [dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port) 413,8 kB2.863,0 kB [dosya listesi]
hurd-i386 419,7 kB2.823,0 kB [dosya listesi]
i386 417,7 kB2.831,0 kB [dosya listesi]
kfreebsd-amd64 371,1 kB2.559,0 kB [dosya listesi]
kfreebsd-i386 419,9 kB2.819,0 kB [dosya listesi]
mips 390,8 kB3.238,0 kB [dosya listesi]
mips64el 387,0 kB3.212,0 kB [dosya listesi]
mipsel 402,8 kB3.242,0 kB [dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port) 380,2 kB3.227,0 kB [dosya listesi]
ppc64el 381,4 kB3.035,0 kB [dosya listesi]
riscv64 (resmi olmayan port) 370,8 kB1.863,0 kB [dosya listesi]
s390x 332,9 kB2.703,0 kB [dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port) 309,3 kB2.355,0 kB [dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port) 361,4 kB2.319,0 kB [dosya listesi]