Paket: hmmer (3.4+dfsg-2 ve diğerleri)

[ Kaynak: hmmer  ]

profile hidden Markov models for protein sequence analysis

HMMER is an implementation of profile hidden Markov model methods for sensitive searches of biological sequence databases using multiple sequence alignments as queries.

Given a multiple sequence alignment as input, HMMER builds a statistical model called a "hidden Markov model" which can then be used as a query into a sequence database to find (and/or align) additional homologues of the sequence family.

Etiketler: Biyoloji: Clustal/ALN, Proteinler, Alan: field::biology, field::biology:bioinformatics, Geliştirildiği dil: implemented-in::c, interface::commandline, Rol: Program, Kapsam: Yardımcı Araç, Amaç: use::searching, works-with-format::plaintext, Şununla çalışır: Veritabanları

hmmer ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.15) [hppa, m68k, sparc64]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.19) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.15) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

• dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

  fast suffix array construction

• sug: hmmer-doc (>= 3.1b2-1) [alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64]

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

  sug: hmmer-doc (>= 3.4+dfsg-2) [amd64, arm64, i386, ppc64, x32]

hmmer indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	3.1b2-1	1.129,7 kB	13.177,0 kB	[dosya listesi]
amd64	3.4+dfsg-2	1.037,5 kB	6.466,0 kB	[dosya listesi]
arm64	3.4+dfsg-2	932,4 kB	7.248,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	3.1b2-1	969,6 kB	10.721,0 kB	[dosya listesi]
i386	3.4+dfsg-2	1.068,1 kB	6.187,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	3.1b2-1	850,4 kB	8.566,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	3.4+dfsg-2	1.011,3 kB	6.929,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	3.1b2-1	908,8 kB	8.358,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	3.1b2-1	840,5 kB	9.376,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	3.4+dfsg-2	1.049,1 kB	6.365,0 kB	[dosya listesi]