tüm seçenekler
stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Kaynak: miniasm  ]

Paket: miniasm (0.3+dfsg-1)

miniasm için bağlantılar

Screenshot

Debian Kaynakları:

miniasm Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Benzer paketler:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Etiketler: Biyoloji: Nükleik Asitler, Alan: Biyoloji, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Kullanıcı Arayüzü: Komut Satırı, Rol: role::program, science::calculation, Amaç: Hesaplama, use::comparing, works-with::biological-sequence

miniasm ile İlgili Diğer Paketler

  • bağımlılıklar
  • tavsiye edilen
  • önerilen
  • enhances

miniasm indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari Paket Boyutu Kurulu Boyut Dosyalar
amd64 29,7 kB70,0 kB [dosya listesi]
arm64 27,5 kB66,0 kB [dosya listesi]
armel 28,0 kB66,0 kB [dosya listesi]
armhf 26,7 kB54,0 kB [dosya listesi]
i386 32,0 kB74,0 kB [dosya listesi]
mips 30,2 kB77,0 kB [dosya listesi]
mips64el 30,2 kB78,0 kB [dosya listesi]
mipsel 30,1 kB77,0 kB [dosya listesi]
ppc64el 32,8 kB83,0 kB [dosya listesi]
s390x 28,2 kB74,0 kB [dosya listesi]