tüm seçenekler
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Kaynak: plasmidseeker  ]

Paket: plasmidseeker (1.3+dfsg-1)

plasmidseeker için bağlantılar

Screenshot

Debian Kaynakları:

plasmidseeker Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Benzer paketler:

identification of known plasmids from whole-genome sequencing reads

PlasmidSeeker is a k-mer based program for the identification of known plasmids from bacterial whole genome sequencing reads.

PlasmidSeeker that enables the detection of plasmids from bacterial WGS data without read assembly. The PlasmidSeeker algorithm is based on k-mers and uses k-mer abundance to distinguish between plasmid and bacterial sequences. The performance of PlasmidSeeker was tested on a set of simulated and real bacterial WGS samples, resulting in 100% sensitivity and 99.98% specificity.

plasmidseeker ile İlgili Diğer Paketler

  • bağımlılıklar
  • tavsiye edilen
  • önerilen
  • enhances

plasmidseeker indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari Paket Boyutu Kurulu Boyut Dosyalar
amd64 26,4 kB94,0 kB [dosya listesi]
arm64 26,4 kB94,0 kB [dosya listesi]
armel 26,4 kB94,0 kB [dosya listesi]
armhf 26,4 kB94,0 kB [dosya listesi]
i386 26,4 kB94,0 kB [dosya listesi]
mips64el 26,5 kB94,0 kB [dosya listesi]
mipsel 26,4 kB94,0 kB [dosya listesi]
ppc64el 26,4 kB94,0 kB [dosya listesi]
s390x 26,4 kB94,0 kB [dosya listesi]