Paket: maq (0.7.1-9)

[ Kaynak: maq  ]

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

Etiketler: Alan: Biyoloji, Biyoinformatik, Geliştirildiği dil: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Kullanıcı Arayüzü: Komut Satırı, Rol: role::program, scope::utility, Amaç: Ek etiket gerektiriyor, Analiz, use::comparing, use::searching, Desteklenen Biçimler: Ek etiket gerektiriyor, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

maq ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [amd64, armel, armhf, s390x değil]

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  compression library - runtime

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

maq indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
amd64	295,7 kB	543,0 kB	[dosya listesi]
arm64	286,7 kB	519,0 kB	[dosya listesi]
armel	285,5 kB	530,0 kB	[dosya listesi]
armhf	286,9 kB	474,0 kB	[dosya listesi]
i386	306,2 kB	575,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	296,9 kB	578,0 kB	[dosya listesi]
mipsel	303,5 kB	577,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	304,8 kB	647,0 kB	[dosya listesi]
s390x	288,4 kB	547,0 kB	[dosya listesi]