Paket: sibsim4 (0.20-5 och andra)

[ Källkod: sibsim4  ]

align expressed RNA sequences on a DNA template

The SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals:

 * speed improvement;
 * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used;
 * provide more detailed output about splice types;
 * provide more detailed output about polyA sites;
 * misc code cleanups and fixes.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::TODO, use::comparing, Searching, Supports Format: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Works with: Behöver ett märke till

Andra paket besläktade med sibsim4

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.30) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

Hämta sibsim4

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	0.20-5	30,9 kbyte	85,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	0.20-5	29,7 kbyte	73,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.20-5	28,1 kbyte	73,0 kbyte	[filförteckning]
armel	0.20-5	27,5 kbyte	72,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	0.20-5	26,2 kbyte	56,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	0.20-5	28,8 kbyte	69,0 kbyte	[filförteckning]
i386	0.20-5	30,8 kbyte	80,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	0.20-5	36,3 kbyte	112,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	0.20-5	25,6 kbyte	60,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	0.20-5	29,3 kbyte	79,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	0.20-5	31,9 kbyte	150,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	0.20-5	31,9 kbyte	85,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	0.20-5+b1	30,7 kbyte	65,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	0.20-5	30,5 kbyte	77,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	0.20-5	29,5 kbyte	60,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	0.20-5	27,7 kbyte	78,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	0.20-5	28,5 kbyte	72,0 kbyte	[filförteckning]