Paket: ssw-align (1.1-14 och andra)

Länkar för ssw-align

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet libssw:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

Andra paket besläktade med ssw-align

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libssw0 (= 1.1-14) [ej riscv64]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

dep: libssw0 (= 1.1-14+b1) [riscv64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta ssw-align

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.1-14	26,1 kbyte	83,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1.1-14	23,3 kbyte	63,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.1-14	20,2 kbyte	82,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.1-14	23,5 kbyte	62,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.1-14	21,9 kbyte	50,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.1-14	26,6 kbyte	78,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1.1-14	31,2 kbyte	94,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1.1-14	23,0 kbyte	66,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.1-14	25,8 kbyte	84,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	1.1-14	26,1 kbyte	83,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.1-14	19,9 kbyte	83,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.1-14+b1	26,5 kbyte	60,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.1-14	27,1 kbyte	71,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1.1-14	28,3 kbyte	82,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	1.1-14	25,0 kbyte	1.043,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	1.1-14	23,1 kbyte	58,0 kbyte	[filförteckning]