Paket: sigma-align (1.1.3-9)

[ Källkod: sigma-align  ]

Simple greedy multiple alignment of non-coding DNA sequences

Sigma (“Simple greedy multiple alignment”) is an alignment program. It's algorithm and scoring scheme are designed specifically for non-coding DNA sequence.

It uses a strategy of seeking the best possible gapless local alignments. This happens at each step making the best possible alignment consistent with existing alignments. It scores the significance of the alignment based on the lengths of the aligned fragments and a background model. These may be supplied or estimated from an auxiliary file of intergenic DNA.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, use::comparing, Supports Format: Plain Text, Works with: Behöver ett märke till

Andra paket besläktade med sigma-align

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.12.0)

  GLib library of C routines

Hämta sigma-align

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	23,0 kbyte	89,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	23,0 kbyte	61,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	22,1 kbyte	89,0 kbyte	[filförteckning]
armel	22,1 kbyte	56,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	20,2 kbyte	48,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	22,6 kbyte	57,0 kbyte	[filförteckning]
i386	23,7 kbyte	60,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	28,3 kbyte	86,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	20,1 kbyte	56,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	23,0 kbyte	91,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	25,8 kbyte	89,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	26,2 kbyte	89,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	23,3 kbyte	53,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	24,0 kbyte	65,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	23,8 kbyte	88,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	21,2 kbyte	1.050,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	22,9 kbyte	56,0 kbyte	[filförteckning]