Paket: megahit (1.2.9-5)

[ Källkod: megahit  ]

ultra-fast and memory-efficient meta-genome assembler

Megahit is an ultra-fast and memory-efficient NGS assembler. It is optimized for metagenomes, but also works well on generic single genome assembly (small or mammalian size) and single-cell assembly.

The software was praised in a Briefings in Bioinformatics 5/2020 review (DOI: 10.1093/bib/bbaa085).

Andra paket besläktade med megahit

• dep: bzip2

  high-quality block-sorting file compressor - utilities

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  GCC stödbibliotek

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-all

  package depending on all supported Python 3 runtime versions

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta megahit

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	1.135,6 kbyte	8.071,0 kbyte	[filförteckning]