alla flaggor
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Källkod: lucy  ]

Paket: lucy (1.20-4)

Länkar för lucy

Screenshot

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet lucy:

Ansvariga:

Externa resurser:

Liknande paket:

DNA sequence quality and vector trimming tool

Lucy is a utility that prepares raw DNA sequence fragments for sequence assembly, possibly using the TIGR Assembler. The cleanup process includes quality assessment, confidence reassurance, vector trimming and vector removal. The primary advantage of Lucy over other similar utilities is that it is a fully integrated, stand alone program.

Lucy was designed and written at The Institute for Genomic Research (TIGR, now the J. Craig Venter Institute), and it has been used here for several years to clean sequence data from automated DNA sequencers prior to sequence assembly and other downstream uses. The quality trimming portion of lucy makes use of phred quality scores, such as those produced by many automated sequencers based on the Sanger sequencing method. As such, lucy’s quality trimming may not be appropriate for sequence data produced by some of the new “next-generation” sequencers.

Andra paket besläktade med lucy

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • enhances

Hämta lucy

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Paketstorlek Installerad storlek Filer
alpha (inofficiell anpassning) 891,6 kbyte6.110,0 kbyte [filförteckning]
amd64 891,1 kbyte6.089,0 kbyte [filförteckning]
arm64 889,8 kbyte6.109,0 kbyte [filförteckning]
armel 892,0 kbyte6.089,0 kbyte [filförteckning]
armhf 889,5 kbyte6.077,0 kbyte [filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning) 891,2 kbyte6.089,0 kbyte [filförteckning]
i386 891,6 kbyte6.093,0 kbyte [filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning) 896,7 kbyte6.121,0 kbyte [filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning) 889,8 kbyte6.085,0 kbyte [filförteckning]
mips64el 892,1 kbyte6.112,0 kbyte [filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning) 892,6 kbyte6.109,0 kbyte [filförteckning]
ppc64el 892,6 kbyte6.109,0 kbyte [filförteckning]
riscv64 891,5 kbyte6.085,0 kbyte [filförteckning]
s390x 893,0 kbyte6.093,0 kbyte [filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning) 892,7 kbyte6.109,0 kbyte [filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning) 891,7 kbyte7.071,0 kbyte [filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning) 891,2 kbyte6.089,0 kbyte [filförteckning]