Paket: cd-hit (4.8.1-4 och andra)

Länkar för cd-hit

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet cd-hit:

Ansvariga:

Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
Tim Booth (QA-sida)
Andreas Tille (QA-sida)
Étienne Mollier (QA-sida)

Externa resurser:

Hemsida [weizhongli-lab.org]

Liknande paket:

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::comparing, Works with: Biological Sequence

Andra paket besläktade med cd-hit

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC stödbibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC stödbibliotek
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC stödbibliotek
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

GNU standardbibliotek v3 för C++

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ej riscv64]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta cd-hit

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	4.8.1-4	505,8 kbyte	1.531,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	4.8.1-4	510,3 kbyte	1.411,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	4.8.1-4	493,8 kbyte	1.309,0 kbyte	[filförteckning]
armel	4.8.1-4	491,0 kbyte	1.319,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	4.8.1-4	487,6 kbyte	1.111,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	4.8.1-4	506,3 kbyte	1.398,0 kbyte	[filförteckning]
i386	4.8.1-4	511,4 kbyte	1.477,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	4.8.1-4	525,4 kbyte	2.178,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	4.8.1-4	506,1 kbyte	1.423,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	4.8.1-4	510,9 kbyte	1.588,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	4.8.1-4	509,0 kbyte	1.813,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	4.8.1-4	508,7 kbyte	1.813,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	4.8.1-4+b1	505,5 kbyte	1.236,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	4.8.1-4	496,6 kbyte	1.429,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	4.8.1-4	510,8 kbyte	1.373,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	4.8.1-4	489,5 kbyte	1.399,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	4.8.1-4	506,8 kbyte	1.381,0 kbyte	[filförteckning]