Paket: allelecount (4.3.0-2 och andra)

[ Källkod: allelecount  ]

NGS copy number algorithms

Support code for NGS copy number algorithms. Takes a file of locations and a [cr|b]am file and generates a count of coverage of each allele [ACGT] at that location (given any filter settings).

The alleleCount package primarily exists to prevent code duplication between some other projects, specifically AscatNGS and Battenberg.

Andra paket besläktade med allelecount

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

  XZ-format compression library

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta allelecount

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	4.3.0-2+b1	28,2 kbyte	119,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	4.3.0-2+b1	28,7 kbyte	91,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	4.3.0-2+b1	27,8 kbyte	119,0 kbyte	[filförteckning]
armel	4.3.0-2+b1	28,3 kbyte	86,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	4.3.0-2+b1	27,2 kbyte	78,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	4.3.0-2+b1	27,8 kbyte	87,0 kbyte	[filförteckning]
i386	4.3.0-2+b1	29,1 kbyte	90,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	4.3.0-2+b1	32,1 kbyte	111,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	4.3.0-2+b1	27,1 kbyte	86,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	4.3.0-2+b1	27,3 kbyte	121,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	4.3.0-2+b1	29,4 kbyte	119,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	4.3.0-2+b1	30,0 kbyte	119,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	4.3.0-2+b2	28,3 kbyte	83,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	4.3.0-2+b1	28,3 kbyte	91,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	4.3.0-2+b1	29,2 kbyte	118,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	4.3.0-2+b1	27,2 kbyte	1.081,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	4.3.0-2+b1	28,7 kbyte	90,0 kbyte	[filförteckning]