Paket: anfo (0.98-9) [debports]

[ Källkod:  ]

Short Read Aligner/Mapper from MPG

Anfo is a mapper in the spirit of Soap/Maq/Bowtie, but its implementation takes more after BLAST/BLAT. It's most useful for the alignment of sequencing reads where the DNA sequence is somehow modified (think ancient DNA or bisulphite treatment) and/or there is more divergence between sample and reference than what fast mappers will handle gracefully (say the reference genome is missing and a related species is used instead).

Andra paket besläktade med anfo

• dep: libanfo0 (>= 0.98)

  Library for Short Read Aligner/Mapper from MPG

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libelk0

  implementation of Scheme (the Extension Language Kit)

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1)

  GCC stödbibliotek

• dep: libpopt0 (>= 1.14)

  Bibliotek för att analysera kommandoparametrar

• dep: libprotobuf23 (>= 3.12.4)

  protocol buffers C++ library

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta anfo

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
hppa (inofficiell anpassning)	115,0 kbyte	387,0 kbyte	[filförteckning]