alla flaggor
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ] [  experimental  ]
[ Källkod: examl  ]

Paket: examl (3.0.22-5 och andra)

Länkar för examl

Screenshot

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet examl:

Ansvariga:

Externa resurser:

Liknande paket:

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) code for phylogenetic inference

Exascale Maximum Likelihood (ExaML) is a code for phylogenetic inference using MPI. This code implements the popular RAxML search algorithm for maximum likelihood based inference of phylogenetic trees.

ExaML is a strapped-down light-weight version of RAxML for phylogenetic inference on huge datasets. It can only execute some very basic functions and is intended for computer-savvy users that can write little perl-scripts and have experience using queue submission scripts for clusters. ExaML only implements the CAT and GAMMA models of rate heterogeneity for binary, DNA, and protein data.

ExaML uses a radically new MPI parallelization approach that yields improved parallel efficiency, in particular on partitioned multi-gene or whole-genome datasets. It also implements a new load balancing algorithm that yields better parallel efficiency.

It is up to 4 times faster than its predecessor RAxML-Light and scales to a larger number of processors.

Andra paket besläktade med examl

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • enhances

Hämta examl

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Version Paketstorlek Installerad storlek Filer
alpha (inofficiell anpassning) 3.0.22-5 834,3 kbyte1.919,0 kbyte [filförteckning]
amd64 3.0.22-5 931,6 kbyte5.969,0 kbyte [filförteckning]
arm64 3.0.22-5 780,5 kbyte1.663,0 kbyte [filförteckning]
armel 3.0.22-5 796,9 kbyte1.872,0 kbyte [filförteckning]
armhf 3.0.22-5 785,1 kbyte1.520,0 kbyte [filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning) 3.0.22-5 813,5 kbyte1.750,0 kbyte [filförteckning]
i386 3.0.22-5 1.078,8 kbyte7.035,0 kbyte [filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning) 3.0.22-5 955,5 kbyte2.818,0 kbyte [filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning) 3.0.22-5 763,5 kbyte1.780,0 kbyte [filförteckning]
mips64el 3.0.22-5 816,6 kbyte1.811,0 kbyte [filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning) 3.0.22-5 836,8 kbyte1.919,0 kbyte [filförteckning]
ppc64el 3.0.22-5 845,9 kbyte1.919,0 kbyte [filförteckning]
riscv64 3.0.22-5 840,2 kbyte1.591,0 kbyte [filförteckning]
s390x 3.0.22-5 818,0 kbyte1.995,0 kbyte [filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning) 3.0.22-5 889,8 kbyte1.852,0 kbyte [filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning) 3.0.22-5 826,9 kbyte3.716,0 kbyte [filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning) 3.0.22-4 782,5 kbyte1.744,0 kbyte [filförteckning]