Paket: edlib-aligner (1.2.7-6 och andra)

[ Källkod: libedlib  ]

edlib sequence alignment tool using edit distance

Edlib is a lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance. This package provides an aligner using this library.

Features of libedlib

 * Calculates edit distance (Levehnstein distance).
 * It can find optimal alignment path (instructions how to transform
   first sequence into the second sequence).
 * It can find just the start and/or end locations of alignment path -
   can be useful when speed is more important than having exact
   alignment path.
 * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and
   infix(HW), each of them useful for different scenarios.
 * You can extend character equality definition, enabling you to e.g.
   have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to
   work with degenerate nucleotides.
 * It can easily handle small or very large sequences, even when finding
   alignment path, while consuming very little memory.
 * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.

Andra paket besläktade med edlib-aligner

• dep: libc6 (>= 2.38) [ej alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libedlib1 (= 1.2.7-5) [ia64]

  library for sequence alignment using edit distance

  dep: libedlib1 (= 1.2.7-5+b1) [x32]

  dep: libedlib1 (= 1.2.7-6+b3) [ej ia64, x32]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ej armel, armhf, hppa, ia64, m68k, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC stödbibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC stödbibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Hämta edlib-aligner

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.2.7-6+b3	22,3 kbyte	87,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1.2.7-6+b3	24,4 kbyte	71,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.2.7-6+b3	23,0 kbyte	87,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.2.7-6+b3	21,4 kbyte	86,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.2.7-6+b3	20,5 kbyte	86,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	1.2.7-6+b3	23,0 kbyte	55,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.2.7-6+b3	23,7 kbyte	62,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1.2.7-5	27,5 kbyte	86,0 kbyte	[filförteckning]
loong64 (inofficiell anpassning)	1.2.7-6+b3	23,5 kbyte	86,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1.2.7-6+b3	22,5 kbyte	62,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.2.7-6+b3	22,5 kbyte	88,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	1.2.7-6+b3	24,1 kbyte	87,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.2.7-6+b3	26,2 kbyte	87,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.2.7-6+b3	21,4 kbyte	51,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.2.7-6+b3	25,2 kbyte	67,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1.2.7-6+b3	25,0 kbyte	86,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	1.2.7-6+b3	20,8 kbyte	1.048,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	1.2.7-5+b1	24,3 kbyte	66,0 kbyte	[filförteckning]