Paket: daligner (1.0+git20240119.335105d-3 och andra)

[ Källkod: daligner  ]

local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

These tools permit one to find all significant local alignments between reads encoded in a Dazzler database. The assumption is that the reads are from a Pacific Biosciences RS II long read sequencer. That is, the reads are long and noisy, up to 15% on average.

Märken: Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program

Andra paket besläktade med daligner

• dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [ej alpha, ia64, loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.42) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

Hämta daligner

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.0+git20240119.335105d-3	213,8 kbyte	1.994,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1.0+git20240119.335105d-3	236,0 kbyte	1.626,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.0+git20240119.335105d-3+b2	224,8 kbyte	1.995,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.0+git20240119.335105d-3	198,1 kbyte	1.128,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	1.0+git20240119.335105d-3	213,7 kbyte	1.554,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.0+git20240119.335105d-3	227,6 kbyte	1.756,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1.0+git20240119.335105d-2	252,4 kbyte	2.877,0 kbyte	[filförteckning]
loong64	1.0+git20240119.335105d-3	228,1 kbyte	1.992,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1.0+git20240119.335105d-3	201,1 kbyte	1.472,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	1.0+git20240119.335105d-3	219,7 kbyte	2.250,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.0+git20240119.335105d-3	231,4 kbyte	2.186,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.0+git20240119.335105d-3	226,8 kbyte	1.238,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.0+git20240119.335105d-3	240,3 kbyte	1.788,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1.0+git20240119.335105d-3	228,8 kbyte	1.664,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	1.0+git20240119.335105d-3	188,4 kbyte	10.454,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	1.0+git20240119.335105d-3	234,2 kbyte	1.556,0 kbyte	[filförteckning]