Paket: bcftools (1.20-1 och andra)

[ Källkod: bcftools  ]

genomic variant calling and manipulation of VCF/BCF files

BCFtools is a set of utilities that manipulate variant calls in the Variant Call Format (VCF) and its binary counterpart BCF. All commands work transparently with both VCFs and BCFs, both uncompressed and BGZF-compressed.

Märken: Implemented in: C, Role: Program

Andra paket besläktade med bcftools

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3-gffutils [ej alpha, x32]

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• dep: python3-matplotlib [ej alpha, x32]

  Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)

• dep: sse2-support [i386]

  CPU feature checking - require SSE2

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

• rec: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

• sug: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: python3-matplotlib [alpha, x32]

  Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)

• sug: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live: LaTeX recommended packages

Hämta bcftools

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.19-1+b1	702,5 kbyte	4.227,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1.20-1	742,1 kbyte	2.632,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.20-1	667,7 kbyte	4.035,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.20-1	657,0 kbyte	2.359,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.20-1	654,5 kbyte	1.824,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	1.20-1	758,3 kbyte	2.509,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.20-1	784,0 kbyte	2.728,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1.20-1	909,4 kbyte	4.403,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1.20-1	643,7 kbyte	2.246,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.20-1	676,3 kbyte	4.355,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	1.20-1	761,0 kbyte	4.583,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.20-1	777,7 kbyte	4.610,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.20-1	735,6 kbyte	2.184,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.20-1	766,4 kbyte	2.739,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1.20-1	797,6 kbyte	3.854,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	1.20-1	726,2 kbyte	42.439,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	1.19-1+b1	716,7 kbyte	2.361,0 kbyte	[filförteckning]