Paket: libbwa-dev (0.7.17-8~0exp)

[ Källkod: bwa  ]

Experimentellt paket

Varning: Paketet är från den experimentella utgåvan. Det innebär att det med stor sannolikhet är instabilt eller innehåller fel, och kanske till och med kan orsaka dataförluster. Se till att läsa ändringsloggen och annan dokumentation innan du använder det.

Burrows-Wheeler Aligner source files

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

This package contains the source files for use in other programs.

Märken: Software Development: Bibliotek, Field: Biologi, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, Role: role::devel-lib, role::program, Source Code, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

Andra paket besläktade med libbwa-dev

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Hämta libbwa-dev

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	170,5 kbyte	630,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	152,5 kbyte	470,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	142,9 kbyte	456,0 kbyte	[filförteckning]
armel	143,3 kbyte	419,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	143,9 kbyte	352,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	169,2 kbyte	480,0 kbyte	[filförteckning]
i386	168,2 kbyte	478,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	208,3 kbyte	773,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	147,1 kbyte	439,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	157,0 kbyte	551,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	161,6 kbyte	540,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	169,8 kbyte	556,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	294,1 kbyte	2.189,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	141,1 kbyte	471,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	197,2 kbyte	428,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	137,2 kbyte	467,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	156,4 kbyte	440,0 kbyte	[filförteckning]