alla flaggor
stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Källkod: miniasm  ]

Paket: miniasm (0.3+dfsg-1)

Länkar för miniasm

Screenshot

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet miniasm:

Ansvariga:

Externa resurser:

Liknande paket:

ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads

Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.

Märken: Biologi: Nucleic Acids, Field: Biologi, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, User Interface: Command Line, Role: role::program, science::calculation, Purpose: Calculating, use::comparing, works-with::biological-sequence

Andra paket besläktade med miniasm

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • enhances

Hämta miniasm

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Paketstorlek Installerad storlek Filer
amd64 29,7 kbyte70,0 kbyte [filförteckning]
arm64 27,5 kbyte66,0 kbyte [filförteckning]
armel 28,0 kbyte66,0 kbyte [filförteckning]
armhf 26,7 kbyte54,0 kbyte [filförteckning]
i386 32,0 kbyte74,0 kbyte [filförteckning]
mips 30,2 kbyte77,0 kbyte [filförteckning]
mips64el 30,2 kbyte78,0 kbyte [filförteckning]
mipsel 30,1 kbyte77,0 kbyte [filförteckning]
ppc64el 32,8 kbyte83,0 kbyte [filförteckning]
s390x 28,2 kbyte74,0 kbyte [filförteckning]