Paket: hmmer2 (2.3.2+dfsg-6)

[ Källkod: hmmer2  ]

Profilerade dolda Markov-modeller för proteinsekvensanalys

HMMER är en implementering av metoder för dolda Markovmodeller för

 känsliga sökningar i biologiska sekvensdatabaser med multipla

sekvensinriktningar sekvensinriktningar som frågor.

 .
 Med en multipel sekvensinriktning som indata bygger HMMER en statistisk

modell som kallas en ”dold Markov-modell” som sedan kan användas som en fråga i en sekvensdatabas för att hitta (och/eller aligna) ytterligare homologer av sekvensfamilj.

Andra paket besläktade med hmmer2

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libpvm3

  Parallel Virtual Machine - shared libraries

• dep: libsquid1

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• rec: biosquid

  utilities for biological sequence analysis

• sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-6)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

• sug: hmmer2-pvm (>= 2.3.2+dfsg-6)

  HMMER programs with PVM (Parallel Virtual Machine) support

Hämta hmmer2

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
armhf	1.510,6 kbyte	2.484,0 kbyte	[filförteckning]