Paket: vt (0.57721+ds-3)

[ Källkod: vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Andra paket besläktade med vt

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  New Perl Compatible Regular Expression Library- 8 bit runtime files

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: r-base-core

  GNU R core of statistical computation and graphics system

Hämta vt

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	756,2 kbyte	2.565,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	624,3 kbyte	2.241,0 kbyte	[filförteckning]
armel	604,2 kbyte	2.152,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	624,4 kbyte	1.524,0 kbyte	[filförteckning]
i386	763,0 kbyte	2.776,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	576,1 kbyte	3.225,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	580,6 kbyte	2.977,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	693,5 kbyte	2.833,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	638,5 kbyte	2.533,0 kbyte	[filförteckning]