Paket: ssw-align (1.1-13)

[ Källkod: libssw  ]

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

Andra paket besläktade med ssw-align

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libssw0 (= 1.1-13)

  fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta ssw-align

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	20,7 kbyte	54,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	19,7 kbyte	50,0 kbyte	[filförteckning]
armel	23,9 kbyte	66,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	22,0 kbyte	50,0 kbyte	[filförteckning]
i386	27,7 kbyte	82,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	27,9 kbyte	76,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	27,3 kbyte	71,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	20,5 kbyte	83,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	25,3 kbyte	75,0 kbyte	[filförteckning]