Paket: seqtk (1.3-2)

[ Källkod: seqtk  ]

Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format

Currently, seqtk supports quality based trimming with the phred algorithm, converting fastq to fasta, reverse complementing sequences, extracting or masking subsequences in regions given in a BED/name list file, and more. It contains a subsampling module to sample exactly n sequences or a fraction of sequences.

Seqtk supports both fasta and fastq input files, which can be optionally gzip compressed.

Andra paket besläktade med seqtk

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta seqtk

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	29,0 kbyte	79,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	27,3 kbyte	75,0 kbyte	[filförteckning]
armel	27,6 kbyte	79,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	27,3 kbyte	63,0 kbyte	[filförteckning]
i386	32,1 kbyte	91,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	28,2 kbyte	89,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	28,6 kbyte	84,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	32,8 kbyte	151,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	27,1 kbyte	83,0 kbyte	[filförteckning]