Paket: damapper (0.0+git20200322.b2c9d7f-3)

[ Källkod: damapper  ]

long read to reference genome mapping tool

Recognised as the Damapper Library, this is a long read to reference genome mapping command line tool.

For a given reference database 'X' and read block 'Y', damapper produces the single file 'Y.X.las'. Each output file is sorted in order of the A-reads, and if a match is a chain of local alignments, then the LA's in the chain occur in increasing order of A-coordinates.

HPC.damapper writes a UNIX shell script to the standard output that maps every read in blocks <first> to <last> of database <reads> to a reference sequence <ref>. If <last> is missing then only the single block <first> is mapped, and if <first> is also missing then all blocks of the database are mapped.

This package contains the damapper and HPC.damapper binaries.

Andra paket besläktade med damapper

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

Hämta damapper

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	103,3 kbyte	300,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	93,5 kbyte	280,0 kbyte	[filförteckning]
armel	94,7 kbyte	298,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	94,7 kbyte	222,0 kbyte	[filförteckning]
i386	106,6 kbyte	338,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	95,3 kbyte	315,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	99,7 kbyte	330,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	108,6 kbyte	428,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	97,0 kbyte	308,0 kbyte	[filförteckning]