Paket: cufflinks (2.2.1+dfsg.1-8 och andra) [non-free]

Länkar för cufflinks

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet cufflinks:

Ansvariga:

Debian Med Packaging Team (QA-sida, E-postarkiv)
Alexandre Mestiashvili (QA-sida)
Andreas Tille (QA-sida)
Charles Plessy (QA-sida)

Externa resurser:

Hemsida [cufflinks.cbcb.umd.edu]

Liknande paket:

Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq

Cufflinks assembles transcripts, estimates their abundances, and tests for differential expression and regulation in RNA-Seq samples. It accepts aligned RNA-Seq reads and assembles the alignments into a parsimonious set of transcripts. Cufflinks then estimates the relative abundances of these transcripts based on how many reads support each one.

Märken: Biologi: Nucleic Acids, Field: Biologi, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Role: Program, Works with: Biological Sequence

Andra paket besläktade med cufflinks

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libboost-serialization1.74.0 (>= 1.74.0)

serialization library for C++
dep: libboost-thread1.74.0 (>= 1.74.0)

portable C++ multi-threading
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [amd64, armel, armhf]

GCC stödbibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 4.1) [s390x]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU standardbibliotek v3 för C++
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

rec: gffread

GFF/GTF format conversions, region filtering, FASTA sequence extraction

enh: tophat

Paketet inte tillgängligt

Hämta cufflinks

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1.500,5 kbyte	10.384,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1.390,1 kbyte	9.869,0 kbyte	[filförteckning]
armel	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1.211,9 kbyte	9.133,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1.114,3 kbyte	6.213,0 kbyte	[filförteckning]
i386	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1.522,5 kbyte	10.603,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1.561,7 kbyte	15.202,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1.500,6 kbyte	13.369,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1.549,2 kbyte	13.797,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	2.2.1+dfsg.1-8+b1	1.314,2 kbyte	10.901,0 kbyte	[filförteckning]