Paket: abyss (2.2.5+dfsg-1)

[ Källkod: abyss  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Märken: Field: Biologi, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program

Andra paket besläktade med abyss

• dep: bsdextrautils

  extra utilities from 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, s390x]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  SQLite 3 shared library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU standardbibliotek v3 för C++

  dep: libstdc++6 (>= 9) [ej armel, armhf]

• dep: make

  utility for directing compilation

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

Hämta abyss

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	2.939,3 kbyte	9.045,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	2.764,0 kbyte	8.373,0 kbyte	[filförteckning]
armel	2.752,4 kbyte	8.369,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	2.798,8 kbyte	6.741,0 kbyte	[filförteckning]
i386	3.029,7 kbyte	9.589,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	2.868,5 kbyte	10.460,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	2.897,2 kbyte	10.313,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	2.895,8 kbyte	11.637,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	2.755,5 kbyte	9.053,0 kbyte	[filförteckning]