alla flaggor
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Källkod: python-nanomath  ]

Paket: python3-nanomath (1.2.0+ds-1)

Länkar för python3-nanomath

Screenshot

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet python-nanomath:

Ansvariga:

Externa resurser:

Liknande paket:

simple math function for other Oxford Nanopore processing scripts

This Python3 module provides a few simple math and statistics functions for other scripts processing Oxford Nanopore sequencing data.

 * Calculate read N50 from a set of lengths get_N50(readlenghts)
 * Remove extreme length outliers from a dataset
   remove_length_outliers(dataframe, columname)
 * Calculate the average Phred quality of a read ave_qual(qualscores)
 * Write out the statistics report after calling readstats function
   write_stats(dataframe, outputname)
 * Compute a number of statistics, return a dictionary
   calc_read_stats(dataframe)

Andra paket besläktade med python3-nanomath

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • enhances

Hämta python3-nanomath

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Paketstorlek Installerad storlek Filer
all 7,8 kbyte38,0 kbyte [filförteckning]